Húsz évvel az utazása után Charles Darwin a Fajok eredete című könyvén dolgozik. Új információkat szeretne gyűjteni az állatvilágról, különösen olyan földrészekről, amelyeket keveset kutatott. Ki más tudna segíteni a híres tudósnak befejezni legismertebb művét, mint a felfedezésre vágyó fiatal természetbúvárok?

Az In the Footsteps of Darwin játékban ifjú természetbúvárok érkeznek a Beagle hajóra, hogy segítsenek Charles Darwinnek befejezni Fajok eredete című könyvét. Ezen az úton tanulmányozod az állatokat,térképeket rajzolsz, publikálod a felfedezéseidet, és elméleteket dolgozol ki.

Tanulmányozz egy állatot vagy inspirálódj egy szereplőtől: Válassz egyet a Beagle előtt lévő három tábla közül, majd helyezd a természetbúvár jegyzetfüzetére. Lehet állat, amit tanulmányozol, vagy inspirációként szolgáló karakter a Beagle korábbi utazásáról. Szerezd meg a táblán ábrázolt bónuszokat vagy a helyezésből adódó további pontszerzési lehetőségeket.
A Beagle útja: Miután letettél egy táblát jegyzetfüzetedre, mozgasd a Beagle-t annyi helyet előre, amennyi távolság van a Beagle és a választott tábla között (1-3 hely), majd húzz egy új táblát, hogy betöltsd az üres helyet az úti táblán.
Célod az, hogy több pontot szerezz, mint az ellenfeleid, meghatározva, hogy ki járult a legjobban hozzá a Fajok eredetéhez.