Az 1347-es évben járunk. Egy katasztrófa készülődik. A Fekete Halál közeleg, és a következő évek során Európa és Észak-Afrika nagy részének lakossága elpusztul a pestis következtében.

A Rattusban a játékosok Európa és Észak-Afrika különböző régióiba telepednek le, miközben a pestis elterjed ezeken a területeken. A játékosok segítséget kapnak a középkori szakmák különböző képviselőitől. Néhányan közülük, mint a parasztok és pékek, segítenek a játékosoknak növelni a népességüket. Néhányan, mint a szerzetesek és apácák, bölcsességet és hitet használnak a pestis elkerülésére, míg a lovagok és katonák által folytatott hadviselés teret ad a pestis terjedésének új területekre. Azonban a pestis nem tesz különbséget. Amikor megérkeznek a patkányok, senki sem érezheti magát biztonságban. Végül a pestis visszahúzódik, és a játék véget ér. Csak ekkor derül ki, ki volt képes megmenteni a népességét, és megnyerni a játékot!