A Kozmikus Állampolgársági Tanács bejelentette, hogy lehetővé teszi két új idegen faj csatlakozását, de elfelejtették elkészíteni a bejelentőlap két példányát - ami azt jelenti, hogy csak egy faj csatlakozhat! Most a két jelöltnek harcolnia kell a bolygók kontrollálásáért, hogy eldöntsék, ki érdemli meg a tanúsított civilizációvá váláshoz való jogot.

A Cosmic Encounter Duel egy kompetitív, önálló játék két fő részére a Cosmic Encounter univerzumban, amelyben te és legközelebbi bará… akarom mondani ellenséged versenyeztek, hogy melyikőtök fog elsőként irányítani öt bolygót. A huszonhét idegen faj mindegyike fel van szerelkezve saját egyedi képességeivel, amelyek valamilyen módon játszanak a játék mechanizmusaival, így előnyt adhatnak neked a harcban, pl. A Csaló, aki fenntarthat egy további taktikát, amelyet bármilyen harchoz felhasználhat a játékban.

Az egyedülálló fajod és képességed mellett húsz űrhajód van, hogy átkelhess a kozmoszon, és fenntartsd az irányítást az öt bolygó felett, amelyekre szükséged van, hogy Tanúsított Civilizációvá válj. Mindaddig, amíg a hajód rajta van egy bolygón, addig az a bolygó a te irányításod alatt áll, akkor is, ha az ellenfelednek is vannak rajta hajói, és meg kell osztanod az irányítást. Ezeket a hajókat csatába állíthatod hogy párbajozzanak, megerősítésként használhatod, vagy visszahívhatod őket egy taktikai visszavonulásra. Csak ne veszítsd el őket egy örvényben, vagy hagyd, hogy a csillagok közötti fekete üresség elnyelje őket, és végül elvesszenek az űrben örökre!

A játékhoz a játékosok húznak és megoldanak Destiny kártyákat, amelyek háromféle típusúak lehetnek: Discovery kártyák, Event kártyák és Refresh kártyák. A Discovery kártyák segítségével az ellenfeleddel felfedezhettek egy bolygót és párbajozhattok az irányításáért, míg az Event kártyákkal tesztelhetitek magatokat a különféle kihívások és kozmikus katasztrófák ellen, a Refresh kártyák pedig egyfajta szünetet kínálnak a hajók helyreállításához, szövetségesek összegyűjtéséhez, és végül felkészülni egy újabb összecsapásra.

A párbaj kezdetén te és az ellenfeled titokban döntötök arról, hogy hány hajót küldtök a bolygóra. A támadás megtervezéséhez titokban kiválasztasz egy kártyát a kezedből és egy állandó taktikát a gyűjteményéből, hogy őrizze a hajóidat vagy felrobbantsa az ellenfeled hajóit, majd harcba szállhattok egymással a bolygó irányításáért, amíg a győztes el nem nyeri méltó jutalmát és a vesztes pedig visszavonul. Miután te és az ellenfeled teljesítetek egy Destiny kártyát, ellenőrizzétek a kártya alján található ikont annak meghatározásához, hogy melyik pakliból kell húzni a következőt, majd a verseny folytatódik.